Media文件夹：
Win 98/ME/2000媒体文件夹。主要包括一些声音和MIDI文件，系统启动、错误等时候发出的声音就是使用这个目录下的文件。
NetHood文件夹：
Win 98/ME网络覆盖目录，使用网上邻居时需要用到此目录。
Win 2000位于Documents and Settings文件夹的每个用户目录中。
Offline Web Pages文件夹：
Win ME/2000脱机Web页面。当某个站点设置成允许脱机使用时，相应的在这个文件夹中会有所对应。
OPTIONS文件夹：
Win MEWin ME特有的文件夹，用来存放安装文件。
Pif文件夹：
Win 98/ME程序信息文件目录。Pif文件是DOS程序的快捷方式。
PrintHood文件夹：
Win 98/ME打印覆盖目录。
Recent文件夹：
Win 98/ME最近打开文档文件夹。这个目录中的内容对应“开始”菜单中“文档”里面的内容。
Win 2000位于Documents and Settings文件夹的每个用户目录中。
Samples文件夹：
Win 98/ME模板文件夹。主要是Windows利用脚本文件处理一些事情的范例，你可以通过记事本来查看这些范例。
SendTo文件夹：
Win 98/ME发送文件夹。目录中的内容对应于鼠标右键菜单中发送的内容，你可以在这里面进行添加而修改发送菜单中的项目。
Win 2000位于Documents and Settings文件夹的每个用户目录中。
ShellNew文件夹：
Win 98/ME/2000新建文件夹。文件夹中的文件是对应鼠标右键菜单“新建”中文件的模板。当你选择“新建”中选择某个文件，，系统就在目录中寻找相对应的模板文件。
Spool文件夹：
Win 98/ME Spool文件夹中有一个Printers目录，在进行打印操作时，打印所产生的转换文件就暂存于这个目录中。
Start Menu文件夹：
Win 98/ME开始菜单文件夹。对应开始菜单中的程序，你可以在这个目录下对开始菜单进行修改。
Win 2000在Documents and Settings文件夹的每个用户目录中有个“开始菜单 ”目录，也是同样的功能。
Sysbckup文件夹：
Win 98/ME系统备份文件夹。系统会自动备份注册表以及系统文件，打包放在这个目录下，需要恢复时只需要解开文件将其覆盖会相应的目录即可。
System文件夹：
Win 98/ME/2000系统文件夹。系统中的重要文件都放在这个目录下，同时在安装新软件时也会向这个目录中拷贝文件。由于这里面很多文件是多个软件公用的，在删除软件时提示要删除这个目录中的文件最好选择不要删除。
System32文件夹：
Win 98/ME/2000 32位的系统的文件夹，里面包含了许多虚拟设备文件。同样也是很重要，在对里面的文件进行删减时也要特别注意。
Tasks文件夹：
Win 98/ME/2000计划任务文件夹，该文件夹包含已计划的Windows任务。Windows将按照指定的时间来运行这些任务。
Temp文件夹：
Win 98/ME/2000临时文件目录。在系统和软件的运行过程中会产生很多临时的文件，就存放在这个目录中。定期清理这个目录中的文件，可以减少硬盘的垃圾。
Temporary Internet Files文件夹：
Win 98/ME IE下载文件缓冲区。使用IE浏览器浏览网页时，系统会自动将浏览过的网页内容放在这个目录中，当你再次打开相同的网页时系统会从这个目录中进行提取，这样可以加快浏览的速度。
Win 2000每个用户都有一个Temporary Internet Files文件夹，位于Documents and Settings文件夹的每个用户目录中的Local Settings目录里面。
Web文件夹：
Win 98/ME/2000该文件夹中的文件主要是一些超文本模板、频道的图标和图像等等。Windows系统中一些窗口的布局也是通过这里面的文件来完成的。以前没有觉得这个目录重要，后来发现欢乐时光病毒就是通过感染这个目录中的文件来达到破坏的目的。
友情提醒：由于系统目录中的文件都很重要，所以在进行修改时要特别小心，如果你对系统不是太熟悉，建立你还是不要去动它们。
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